江戸時代、現在の東京都品川区に位置する「溝口村」に由来するとされています。この地域は、品川や渋谷などと並ぶ武家屋敷が立ち並ぶ土地で、中でも溝口村は戦国時代から続く歴史を有していました。「溝口」の名前は、その地域にある水路（溝）の入口に由来しているとされています。水は生命の源であり、農地への灌漑や生活用水として欠かせないものでした。そのため、水路やその入口を管理する家や地域が「溝口」と呼ばれるようになったのです。
また、地理的背景としては、品川区は古くから東海道（東京 - 京都を結ぶ街道）沿いに位置し、交通の要所として栄えていました。村落の名前である「溝口」も、交通路や流通に関連する地名として名付けられた可能性が考えられます。また、水路があることから水運が盛んだった可能性もあります。
感じの意味としては、「溝」は地面にできたくぼみや凹みを指し、より広い意味で隔てや仕切りを表します。一方、「口」は出入りの入り口や境界線を表します。この二つの文字を組み合わせた「溝口」は、物事や空間を仕切り、分ける役割を持つ存在を指すかもしれません。つまり、「溝口」という名字は、場所や人々を結びつける役割を果たしてきた家柄や地域を示している可能性があります。
以上のように、「溝口」という名字の由来は、地域の歴史や地理的背景、言葉の持つ意味など様々な要素が組み合わさっていると考えられます。